除了新角色,《马达加斯加3》最大的亮点就是首次采用3D拍摄。与实拍电影不同,3D技术可以在动画片里随心所欲地呈现出来,更不用提还有马戏团这个绝佳背景为3D提供完美的表现平台。导演之一埃里克·达内尔表示:“他们不仅在地上活动,还会在空中跳跃、空翻和飞行,这些以3D表现效果一定很棒。”已经看过的观众也证明,此次的3D效果不错,网友“bR A dY -10”即评论称,“我本人一向是不太喜欢3D片的,但这部是一个惊喜,几分钟之后我就完全忘记自己戴着3D眼镜了。”2009年1月,梦工厂动画的CEOJeffrey Katzenberg在被问到是否将发行第三部作品时,他答道“是的,我们目前正在制作第三部,它将于2012年夏季上映”